女主角三叶，一名生活在日本小乡镇系守县的高中女生，在一个阳光明媚的早晨醒来。她感觉自己做了一个很奇怪的梦，梦到自己和别人交换了身体，但是又想不起来发生了什么。她还没来得及多想，就得匆匆忙忙上学去了。到了学校以后很多同学都用异样的眼光看着他，她的两个朋友告诉她，她昨天到学校的时候奇奇怪怪，头发也没扎，也想不起来自己叫什么名字，感觉变了一个人一样。之后在上课的时候，还发现她的作业本有人写着“你是谁”三个字。这让三叶更加困惑了，到底昨天她自己做了什么，为什么一点印象都没有。
到了晚上，三叶开始和外婆，妹妹一起在家缠结绳，原来三叶一家，是他们系守镇神社重要的继承人，每年都要用自己编织的结绳和一些贡品去祭拜当地的神明。晚些时候，三叶还要和妹妹做礼拜，制作贡品，这个贡品可不是一般的鸡鸭牛羊。而是一种米酒叫口嚼酒，嚼就是那个细嚼慢咽的嚼。这种酒怎么做呢，就是需要三叶吃上一口米饭，然后在嘴里不断的细嚼慢咽，让米饭和自己的唾液在嘴里自然发酵，然后在吐出来。就变成口嚼酒。哇，说到这里我自己都觉得有点小恶心。
三叶的外婆说，这种口嚼酒，等于是把你自己的半个灵魂奉献着神明，让神明在另一个世界给予保佑。虽然这些祭祀活动看起来很神圣也很庄严，当然也很奇怪。但是对于刚步入高中的三叶来说，所有这些都显得很奇怪，在这样连一个咖啡店都没有的小乡镇里，她实在是受不了，终于在祭祀回家的路上，她忍不住对着夜空喊出自己心中的愿望，我要去东京！我想变成东京的一名帅哥！
就在呐喊完以后，轮到影片的男主角泷，同样在一个阳光明媚的早晨醒来。男主角的名字就一个字，叫泷，三点水加上龙飞凤舞的龙。泷是生活在大城市东京的一名男高中生。他醒来以后，感觉周围的一切都非常的奇怪。原来，在泷的身体里，不是泷，而是三叶。也就是说，系守镇的女高中生三叶和东京市的男高中生泷交换了身体，并且这种交换身体不是交换以后就换不回来的。而是充满着随机变数。之后他们渐渐发现。每周他们之间可能会有2到3次的交换身体，为了不影响对方的正常生活和社交圈。他们约法多章，比如交换身体以后，不能摸自己的敏感部位，然后还要注意各自的坐姿。还有不要乱花钱，不要改变自己原本有的社交圈。而且为了换回身体以后避免对方忘记前一天换身体的时候做过什么，互相要在手机上写日记，给换回身体的对方阅读，避免造成不必要的麻烦。他们之间还互留了电话号码，在紧急状态下可以拨打给对方。
那么他们约法多章的合同有没有达到效果呢。当然是不可能的啦。泷只要换到三叶的身体，早上一起来就开始摸自己的胸，欲罢不能呀。毕竟是青春期的男生嘛，可以理解。而且泷依靠自己本来就是男生的性格，在打篮球和各种体育上表现突飞猛进，还引起了女生的爱慕，居然还有女生写情书给三叶。当然也有不少男生开始追三叶。不过这些都是交换身体后泷的功劳。这个功劳应该叫上双引号。而换到泷身体的三叶，发现泷暗恋一位打工期间认识的女生。于是三叶依靠自己温柔可爱的举动，成功引起来那位女生的注意，并且他们还是时不时约会起来。这个功劳，也归功于交换身体以后的三叶。
那泷和三叶自己本身当然不满意啦，交换身体以后居然开始改变自己的社交圈甚至开始改变自己的人生轨迹，这和之前想的越来越不一样了。但最最重要的还是，他们之间开始慢慢有了情愫。泷开始发现自己喜欢了这位来自系守镇的女孩子，而三叶也觉得泷开始成为自己生命中很重要的人。
于是，在一个寂寞的夜晚，泷拨打了三叶的电话。而此时在系守镇的三叶，也拨打了泷的电话。
但事情怎么可能发展这么顺利呢，他们双方的电话都是空号。这让事情本身增加了神秘感。而就在打电话而打不通的那个晚上，泷和三叶，再也没有交换过身体。泷为了解决一切事情的谜团，也为了真正能见上三叶一面，决定自己去找三叶，他凭着自己交换身体时的记忆，把系守镇的风景画出来，然后通过谷歌地图等各种手段，开始去寻找自己也不知道具体地址的三叶的家乡。在经过各种挫折和反复以后，终于，泷找到了三叶的家乡系守镇。但是让他惊讶的是，早在三年前，一个1200年一遇的彗星经过地球分裂出来的碎片正好就坠落在系守镇。也就是说，系守镇早在三年前，就因为彗星碎片的坠落，被夷为了平地。造成了500多人死亡。当时新闻和报道都非常轰动。而这个时候泷也想起来三年前的新闻。但是他和三叶交换身体是这几周才发生的事情，泷交换到三叶身体后看到的系守镇，是完好如初的呀。接着泷去档案馆查找系守镇500多人的死亡名单。发现和他交换身体的三叶，也赫然在死亡名单上面。泷感觉后背一阵发凉，鸡皮疙瘩掉满地。这到底是怎么回事呢！？
就在泷困惑找不到答案的时候，他开始注意到自己的手上，系着一个红色的结绳，这个结绳就是三叶系头发用的红色结绳，而神奇的是，这个结绳是三年前有一位神秘人送给泷的，但是泷却记不起来到底是谁送给他的。他这个时候也突然回想起来一条线索。就是三叶做的口嚼酒，那个口嚼酒，如果真的存放着三叶的半个灵魂，或许找到那个口嚼酒，就能找到问题的答案。
于是在第二天早晨，泷靠着自己之前交换身体的记忆，翻山越岭，找到了存放三叶做口嚼酒的那个神社。也终于找到了存放在那三叶的口嚼酒，那口嚼酒的瓶子，已经爬满了青苔。这证明了一点，泷交换身体的三叶，确实是三年前的三叶，而三叶交换身体的泷，就是三年后的泷。也就是说，他们不光交换了身体这么简单，而是错开了时间和空间交换了身体。所以也不能理解，他们互拨电话为什么是空号，他们为什么时常想不起来交换身体所发生的事情，感觉交换身体的时候是在做梦，因为这存在一个时空发生与被发生的记忆逻辑。打个比方说，三年前发生的事情，交换身体发生以后，才能在三年后泷的记忆里存在。这个问题具有一定的哲学性，也就是先有鸡还是先有蛋的问题。那么影片精彩的点也就在这里。于是泷慎重的拿起了三叶的口嚼酒，打开瓶子，呈上一杯，一饮而尽。
神奇的事情发生了。泷开始进入幻觉，三叶的一生，开始展现在泷的脑海里，包括三叶的出生，三叶的母亲因病去世，父亲因为三叶母亲的去世伤心绝望，放弃了家族传统，走上了政治道路，最后成为了系守镇的镇长。而最重要的是，泷通过幻象了解了三叶的死因，那是因为彗星碎片坠落的那一晚，系守镇举行着一个活动，全镇的人都聚集在彗星碎片坠落的地方，包括三叶。
而因为喝三叶的口嚼酒，他们再一次错开时间和空间，交换了身体，更神奇的是，泷交换到三叶身体的那一天，是彗星碎片坠落当天的早上。也就是说，泷可以通过自己知道后面要发生的灾难去改变历史改变悲剧。于是泷开始构思一个冒险的避难计划。他让三叶的好朋友一个去炸掉系守镇的发电厂，一个去广播，告诉大家电厂爆炸会引起森林火灾，所以大家要赶往避难处暂时避难，从而躲过彗星碎片坠落造成人员伤亡。但泷tyngtsple。大家没有听他的话，毕竟很没有说服力，大家该吃吃该喝喝该玩的玩。这个时候在三叶身体的泷就在想，要是真正的三叶知道这个灾难并且实施避难计划，肯定能说服大家。想到这里的时候，他恍然大悟，既然现在我和三叶交换了身体，那么三叶现在应该就在我的身体里面，而我的身体正好就在三年后损毁的系守镇，所以等我的身体醒来以后，三叶不就看到三年后的系守镇毁灭的样子了吗。
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