除了各国忍村之外，这次事件受到影响最大的便是根部，木叶普通村民对这个部门不是很了解，但是由于火影辅佐团藏在木叶政坛的活跃，绝大多数忍者都知道这个部门的职责。
如今刚刚被绳树执掌三个月的暗部发现了各国针对木叶的阴谋，并一举将潜入的间谍一网打尽，而被团藏高调宣称一直在不为人知的地下默默守护着木叶的根部却没有任何作为，甚至让大量间谍潜入并大摇大摆地建立情报网络而不自知。两相对比之下，根部看上去就像只会打嘴炮一样，知情人士纷纷调侃，称根部潜伏得实在是太深，以至于自己都看不见地面上的情况了。
听到这些议论之后，团藏深感耻辱，却无法反驳，这几年他将大多数精力都用在扩张与培养根部成员之上，以至于对木叶内部的监视工作有些疏忽。
之前各国使团集聚木叶谈判期间，团藏正在一门心思地蕴酿他的全面战争计划，更是命令根部大量人员在村内散播舆论，所以并没有插手对各国使团的监视，而是将这种没有油水可捞的苦活累活交给了暗部。
如果让他发现谈判期间各国使团曾经在木叶内与间谍取得联系，一定会趁机发难强行将各国使团捕捉，这样一来合谈计划就会彻底破裂，整个木叶都会被他强行绑上战车，他的战争计划就一定可以顺利进行了。
在得知整件事的真相之后，团藏为自己错失良机感到懊恼不已，同时将对他隐瞒一切的三代与绳树给恨上了。
可是他知道这种暗地里的交锋是不能挑明的，就像他之前散播言论，试图利用舆论来绑架绳树与木叶一样，只要没有越过底线，双方就不会撕破脸，将事情放在台面上。
与团藏完全相反的是，三代火影现在的心情非常好，对于绳树策划的这次行动也非常满意，不仅将隐藏的危机尽数解决，而且没有造成任何伤亡事故，最重要的是群众舆论一片叫好。
暗部是属于火影的嫡系力量，由于部门性质的特殊性，所有一切信息都会进行保密，不管获得了多大的功劳做出了多大的牺牲，都不会有人知道。
对于这些默默付出的无名英雄，三代火影一直心怀愧疚。
而这次任务由于情况特殊，无法做到完全保密，使得整个暗部半公开式地出现在群众的面前，虽然身份依旧没有开公无法获得个人荣誉，但是整个暗部在木叶的形象已经发生了巨大的改变。
经过这次事件之后，暗部依然保持着神秘，但是却不像原来一样让人恐惧排斥，而是能如同其他忍者一样受到群众的尊重与爱戴，如今这份神秘想反而使暗部多了一种别样的魅力，引得众人探究议论甚至崇敬。
而这一切都是绳树带来的，他以天行者的个人魅力，给暗部打上了独特的烙印，虽然具体形象任然模糊不清，但是整体印象却是积极向上的。
所以这次“除虫”行动之后，三代火影已经彻底肯定了绳树的领导能力，决定不再过问插手暗部的任何具体事务，彻底将整个暗部都交给绳树全权处理，而他本人只需要与绳树沟通便可。
不管外界如何纷纷扰扰，绳树本人却没有受到任何干扰，“除虫”行动成功之后，绳树对暗部的改革便告一段落，剩下的具体日常事务将由六位大队长负责。
而他这位暗部部长除了分出一个下忍分身在办公室内统筹全局之外，他的本体每天都会披着“天行”的马甲，借助暗部的便利进行修炼。
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