马来西亚在行政上由13个州和两个联邦直辖区组成，共有国土面积约329758平方千米，分为西（马来半岛）、东（砂拉越和沙巴）两部分。其中，西马约占国土总面积的38.6%，东马约占61.4%，中间是南中国海，两部分相隔为540千米。马来西亚总的地理特征是海岸线长，山地多，平原少；热带雨林覆盖面广；受热带和海洋环境影响，高温多雨，河流密布，沼泽多，红树林景观独特；动植物、矿产和海洋资源丰富，尤其是新发现的石油和天然气蕴藏量大。
一、西马（马来半岛）
西马由马来半岛及其周围的许多大小岛屿构成，较大的岛屿，如Pulau Langkawi、Pulau Penang（槟榔屿岛，均与玻璃市相邻）、Pulau Pangkor(与霹雳相邻)、Pulau Angsa（位于巴生港口附近）、Pulau Tioman(在东海岸外)等。马来半岛呈狭长形状，位于北纬1°20’至6°40’与东经99°35’至104°20’之间，地近赤道。北端与泰国接壤，南端隔柔佛海峡(the Strait of Johor)与新加坡为邻，面积约131598平方千米。
根据有关地质演变理论，今天的亚洲和澳洲本来是连在一起的，而连接它们的是一个被称做“印度尼西亚远古大陆”(the In-donesian Pri)的地块。早在古生代时期，该地块开始下降，形成地槽，淹没于海水之下。
马来半岛的形成与这一远古大陆的变迁有密切关系，是该大陆漫长的下降、沉积及其伴随的造山运动，最终造就了马来半岛的基本地貌。时间大概是侏罗纪晚期至白垩纪早期，即约1.27亿至1.52亿年以前。
从地理结构上看，马来半岛原属于古老的大陆板块——巽他地台的一部分，该地台也在更新世结束时随着两极冰盖融化，海平面上升，大部分已被淹没于浅海之下。
马来半岛的地貌特征是多山，纵向平行排列着一系列山脉，从西到东，有Banjaran Bintang（滨登山脉）、Banjaran Titiwangsa（主干山脉）、Banjaran Gunung Tahan（大汉山脉）和BanjaranTimur(东岸山脉)。主干山脉及其以西诸附属山脉，均源于侏罗纪晚期和白垩纪早期山系；大汉及东岸山脉则更为古老，乃生成于古生代结束之际。由于地处热带，历经上亿年的风剥雨蚀，除大汉山脉外，其余山脉顶部原有的极厚的沉积岩早已不见，致使花岗岩岩体外裸。主干山，顾名思义，是马来半岛的一座最主要的山脉，被称做半岛脊背，北起泰国，南至森美兰，长约483千米(300英里)，宽约48千米至64千米（30至40英里），有数座高峰，其中最高者为Gunung Chamah(哥布山)，海拔2171米，是半岛东、西两部的分水岭。马来半岛最高的山峰是Gunung Tahan（大汉山），海拔2 187米。
马来半岛的山脉集中在中部和北部，构成同一块山核(themountainous core)，就在其所在的高地上，有金马仑（彭亨境内）、丁加奴等高原。位于半岛中东部的丁加奴高原，包括本农(Be-num)、大汉、东岸等山脉的北部山脉，呈极度切割状态，海拔平均为2500英尺。半岛的中部和北部的部分地区还有许多石灰岩孤山，突兀孑立，边缘陡峭，鲜有植被，高度几百到几千英尺不等，并有大量石灰岩洞。在玻璃市与泰国边境一带，与石灰岩山脉并存的，是许多大的盆地和地坑，底部平展，四周为石灰岩悬崖峭壁，在当地被称做wangs，较大者被马来人辟为居住地。吉兰丹、丁加奴、彭亨以及柔佛东部一带，为一系列低矮山脉，与海岸线呈大体平行走向，时而向内陆延伸达数英里。这些海滩山脉在当地被称做permatang。
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