第二天，千钧与新一在帝丹高中会合，二人商量一下就立即逃课，匆忙驱车赶往警视厅，果然警视厅出了大案子。东京市副市长夏咲样平突然在医院中意外身亡，鉴识科确定是服用超量某种AT药品中毒身亡。警视厅目暮警官亲自带队详细调查了负责病房的医生、护士和清洁工，没有发现任何破绽。值班的医生说当天晚上夏咲样平声称肚子疼，主动要求开一瓶AT药品。
护士说，事发当晚，夏咲样平精神极度抑郁，情绪很不好。他的秘书大塚曹男也声称夏咲样平正在接受上层关于他是否受贿的调查，后来证明确实有此事，但受贿之说暂时查无实据。于是目暮警官他们开始怀疑夏咲样平是自杀，但是他的女儿夏咲美富坚持不肯相信父亲是会自杀的，因为父亲那天还答应她一起去樱花渠踏青，顺便看望孤儿院的孩子们。所以夏咲美富就托了佐藤警官请工藤新一来帮忙调查一下。
新一很快就开始约见所有的相关人，重新听取他们的口供，经过调查新一很快就发现当天晚上还有一个女人到过夏咲样平的病房，而且当值的护士西城陈子在说谎话。这时候千钧第一次见到了传说中的高木警官，人长得挺帅气，就是有点畏畏缩缩的，有时候很搞笑。这家伙现在刚到警视厅不久，还是个菜鸟，跟着目暮警官身后跑龙套，没事的时候总偷着看佐藤警官。
高木对新一的推理非常惊讶，不自觉的就开始执行新一的指令，让目暮警官大为恼火，到底谁才是他的顶头上司。接下来千钧用特殊能力的终端激波稍微刺激一下那位西城陈子，陈子在害怕之下交待，那天晚上自己的表姐加纳雁子曾经到过夏咲样平的房间，这位加纳雁子与夏咲样平有些不正当关系，她也是怕受到牵连才没有说。目暮警官大怒，顾不得责怪陈子做假口供，命令高木马上带队去抓加纳雁子，可等高木赶到时候，加纳雁子却失踪了。
过了两天后，佐藤再次来学校找到新一和千钧，告诉他们一个不好消息，西城陈子被不知名的人给绑架了。可是新一反而觉得这个案子开始有点头绪了，千钧再次借助了黑闪的惊人追踪能力，一直带着警视厅的人马赶到一个郊区附近的小区，成功找到了一个贩卖女子的犯罪团伙，西城陈子就在其中，加纳雁子竟然是这个团伙的联络人。
高木警官觉得立功的机会到了，兴冲冲的杀了进去，大叫我是警察举起手来，结果被犯罪团伙开枪打伤了手臂，多亏了佐藤及时开枪相救，才保住小命。目暮警官很快就指挥警察们经过一番枪战后抓住所有的犯罪分子，把最近失踪的妇女全部救了出来。
恼怒万分的目暮警部对高木不听从命令擅自行动的行为大加训斥，高木一脸沮丧，佐藤帮忙求情，“好了，目暮警部，高木也是第一次出这么大的任务，难免有些紧张，而且他还受伤了。你就原谅他一次吧。”目暮警官只好点了点头，“那就看着佐藤警官份上，这次就算了。真是的，早知是是这么危险的行动就不带你这个菜鸟了。”高木在旁边不停道歉，“哈伊，对不起，目暮警官。我下次一定会听从你的行动安排的。”
然而抓到的加纳雁子声称当晚确实进入夏咲样平病房，二人发生关系后，她洗完澡就直接离开了，当时夏咲样平情绪非常低落，声称活着没有意思，不如自杀了事。这时候搜查课其他几位警官在夏咲样平的住处找到他藏匿的大量现金和珍贵宝石，证明是他受贿的证据。所以松本警视也认为这个案子可以以夏咲样平自杀结案。但是工藤新一坚决不同意，他觉得很多地方太巧了，千钧认为新一是多次一举，既然警方都认为是自杀了，他们两个何必给人家找麻烦，其实千钧是担心这件案子会涉及到高层的政治斗争。
回到学校的新一依然闷闷不乐，连小兰和麻美都不能让他开心起来。千钧暗道，这家伙还真是推理狂人啊。文良跑来询问千钧什么时候安排英雄救美的戏码，千钧无可奈何，现在根本就抽不开身啊，于是就随口说稍等几天就会安排了。而这时候夏咲美富通过泽口云灵的关系找上门来，夏咲美富与泽口云灵哥哥曾经是同学，她希望工藤新一能够帮她把父亲的死因查清楚，新一一口就答应了。
千钧知道这件事情非得继续调查下去了，那么首先最值得怀疑的依然是那个加纳雁子。而这时候目暮警官接到报案，发生一起纵火案，现场的一位死者被烧的面自全非，身份无法确定，只能勉强推测是个女子。唯一的线索是一件送水的广告衫。很快佐藤警官和高木警官就追查到了送水的人员门城吾肋，门城吾肋发现不好，立即驾车逃跑，佐藤带着高木飙车猛追，门城却出前面的高速路口出车祸意外身亡了。
这时候千钧和新一却找不到刚刚被假释的加纳雁子，连她的表妹西城陈子也没有再见过她。千钧着急之下只好让黑闪再试着找一找，可黑闪找到那家纵火现场后就再也找不到别的气味了。新一也是头疼，只好打电话到警视厅询问，才知道目暮警官他们刚好正在追查那件纵火案，那么被烧死的人，高木警官立即抢先回答，肯定是加纳雁子。
于是目暮警官马上下令进行颅骨和DNA核对，结果证实了高木警官的推测。目暮警官大惊失色，知道这件案子恐怕非常复杂了。新一和千钧根据高木所说的门城吾肋之死，很快就找到了制造车祸的H道人物龟平晓三，将其抓住后在千钧的人棍恐吓方法逼问下，龟平说出一个重要线索，那位夏咲样平副市长死的时候，加纳雁子带着一个女人一起到了夏咲样平的房间，这下子终于把新一推理上的疑惑解开了，新一一直怀疑那天到过病房的不止一个女人。
这时候，泽口云灵紧急报案，她的好朋友夏咲美富被两个混混用刀捅伤了，幸好当时她和文良路过，就救下了夏咲美富。工藤新一立即就知道这恐怕是背后凶手的肆意报复，请目暮警官赶快加强对夏咲美富的保护。这时候工藤新一根据推理，很快就找到了另一个疑点很大的女人，毒贩二宫的情妇浜崎令子，目暮警官就下令立即追捕浜崎令子，高木警官这次表现神勇抓住了毒贩二宫。
可二宫说他很久没有见过浜崎令子了，而浜崎令子好像凭空消失了，仿佛没有这个人存在一样。千钧觉得那个二宫肯定没说实话，建议警视厅采取些暴力措施，但被目暮警官拒绝了。于是二宫被释放，他跑到了米花汀附近找到了浜崎令子，二人商量着赶快一起远走高飞，可是浜崎令子却突然出手杀死了二宫，她觉得自己一个人更安全。外面听到声音不对的佐藤警官立即冲进去成功擒住了浜崎令子，原来她一直在暗中跟踪二宫，新一和千钧也在外面藏着，这是他们欲擒故纵之计。
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