当太阳照射入房间时，千钧心满意足的从床上起来，有了女人的感觉还真是不一样啊。他惊奇的发现体内的生命源泉充满了生命原力，他终于知道了生命源泉除了通过从9种自然力量那里转换外，可以从相爱的人那里得到补充，他有点好笑的感觉。自己这些年来费了多少自然力量，居然在昨晚一夜之间就得到了同等的生命原力。
而且，他察觉那9颗各系力量晶石突然间把体内的生命原力一下子吸光了，于是9颗晶石恢复强大的感应和储备能力，那颗代表地球和生命的蓝色晶石也光芒四射，现在通过蓝色晶石能够感应到其他的力量晶石，这个还真够邪门的。千钧却坐在床上喘气，真是够呛啊，现在生命源泉几乎枯竭，自己可不想再通过其他9种自然力量进行转换，太不划算了，恩，今天晚上可以找绫花来慢慢恢复，这个速度可快多了。千钧拿起那颗靛青色的风之晶石，就把它送给绫花吧，她一定很开心的。
千钧奇怪绫花怎么今天没喊自己起床吃饭，这才发现绫花突然不见了，只看到餐桌上留下的一封泪水印湿的信。他感觉绫花可能有事情了，打开信，果然写满了离情别绪，最后面写着，“与君四年相知，蒙君怜惜，恩爱如蜜，今日相别，只恐相见无期，望君珍重。红颜挚爱吉野绫花别笔，×××。”手中的信飘落在地，千钧呆呆发愣，多情自古伤离别，这种事情自己怎么会碰到。
发了一会呆，千钧逐渐恢复过来，强行压下心里的悲伤，自己得想办法把她找回来，继而摇了摇头，瞧信里的意思，她好像要去做一件重要的事情，恐怕事情结束前就算把她带回来她也不会开心。千钧感叹，天要下雨娘要嫁人，让她去吧。如果有缘，还会再见面的。当他看到绫花留给自己的早饭，还有好多地方都贴满了温馨的纸条，提醒自己各种事项，心里的悲伤再也忍耐不住，眼泪不争气的往下掉。
吉野绫花平时就像个好妻子好姐姐一样，把所有的事情都不声不响地替自己做好了，现在她突然走了，千钧的心里空落落的。千钧恼怒，可恶，我可是好久没有掉过眼泪，这个死丫头，下次见到一定要她好看。
正当千钧化悲愤为食欲努力与早餐较劲时，却意外接到阿笠博士的电话，让他赶快过去一趟，出了大事情。当千钧看到眼前这个缩小版的新一时，大惊失色，“博士，这个是新一的弟弟吗？我K，工藤大叔与有希子姐姐造人的速度是不是太快了点？不会是双胞胎还有一个吧？”千钧没有一眼认出是柯南来，是因为他印象中的柯南一直戴着个大眼镜。博士差点晕倒，新一也是一脸黑线。原来新一因喝下尚未研制成功的神秘毒药，身体神奇般的变小了，甩开了到处寻找受伤孩子的两个巡警，在天亮时逃回自己家，然而却不够高打不开大门。
这时刚好听见一声爆炸，博士再次从倒塌的墙下爬来出来，实验又失败了。阿笠博士起初认为他是新一家的亲戚，还好心指路。新一只好说出自己的身份，他现在需要别人的帮助，为了让博士相信，新一说出博士的秘密。博士今年五十二岁了，新一说他虽然自称是天才，其实制造的东西多是破铜烂铁，唯一的成绩是花了十年时间才研究出了最新的手机。
博士屁股有黑痣，长毛，博士十分生气，怀疑工藤新一把自己的事情到处乱传。新一解释说自己是因为喝了毒药变小，博士根本不相信有这种药物，认为他是个奇怪的小鬼头，胡说自己是新一。因此博士要拉他见警察，新一只好用推理证明了身份。
千钧听完介绍大吃一惊，晕啊，昨天新一是碰到黑暗组织的琴酒和伏特加了，小兰也没有向自己提起云霄飞车事件。偏偏自己昨晚忙着推倒绫花，不然的话把他们两个干掉，以后就不用担心同时与两个庞大组织作战了，这两线作战是兵家之大忌。在帮着新一穿上小时候的衣服后，千钧生气埋怨，“可恶，新一，你逞什么能啊？发现事情不对你为什么不赶快通知我就单独行动？你看看现在弄成这个样子，跟踪偷窥不是你的特长。要是我在早把他们都抓起来了，真是的。”新一也是悔得肠子都青了，果然是术业有专攻，可是现在只能想办法变回去才是正理。
新一要求阿笠博士赶快给自己制造解药。博士苦笑，不知道药的成分，没法弄啊。博士提醒他保密，否则会引来不可预料的杀机。千钧皱着眉头，“新一，这个组织能发明出这么厉害的药物，绝不简单。你说的那两个家伙肯定也是了不起的高手，才能那么快就发现你。现在倒是有一个人能帮助我们，他是专门对付这种奇怪的组织的，前提是你不怕他把你解剖分析就行。”新一满脸冷汗，“切，我早想过了，不行啊，我可不想被山本一夫那个屠夫拿去做实验，那家伙出了名的没人性。”倒是博士第一次听说山本一夫的名字，千钧向他解释了秘密调查局的事情。千钧提出让博士给他与新一弄个小型的通讯器便于联络，手机的话，现在小孩子用太显眼了。
趁着博士忙着去找通讯器材，千钧急忙低身问：“新一，你昨天把小兰给推倒了吗？”新一一脸郁闷，“没有，根本就没来得及啊。”千钧一脸幸灾乐祸，“让你早点动手，你就是不听。现在弄得鸡飞蛋打……”新一也是黑着脸，“你还说，你是不是我搭档？可恶，赶紧给我想办法，我这个样子怎么去见小兰和麻美啊？”千钧挠了挠头，“新一，这个我可真没办法了，你知道我对药理学一窍不通啊。不过，这个组织研究这种药品是不是想找到长生不老的办法？”
新一也吃了一惊，“有这种可能，可现在资料太少怎么办？孙子兵法里面还说知己知彼百战不殆呢。”千钧说道：“新一，你首先得有个新的身份吧，否则他们发现你没死肯定会找上门了，有千日做贼的哪有千日防贼的啊。”新一低头陷入沉思。博士兴冲冲的过来，拿来了一个徽章和一个腕表，徽章交给新一，腕表交给千钧，并解释了使用方法。千钧忍不住赞叹博士可真行，博士笑，“呵呵，这个实际上是我研究手机时不成功的两个实验品，两个器材只能彼此相互联系，其实没太大用。”
早上，小兰一晚上没睡好，天亮打电话到新一家，没人接听。而毛利大叔在家里又制造了一堆垃圾，小兰很是生气，说妈妈就是这样被气跑的。小五郎恼怒，“我也有选择工作的权力，当侦探的没有一个好东西，以后你少跟那个装腔作势的新一来往。”小兰苦笑，“爸爸，你自己不也是侦探吗？”小兰担心新一，而工藤夫妇3年前就都去了美国，决定立即出去找，大叔郁闷大叫我的早餐呢？
小兰一路疾跑赶到工藤宅，发现门开了，心里大喜，以为新一已经回来了，就大喊着进去。阿笠博士和千钧都吓了一跳，急忙让新一先躲起来，小兰进来后见到博士和千钧，奇怪新一怎么不在，千钧开始扯谎，“小兰，新一突然接到一件超大的案子，不得不连夜到外面办案去了，一时间没办法回来，托了我和博士照看一下家里，顺便告诉你一声。”
小兰听了脸上都是失望和恼怒，开始埋怨起新一来，而新一在里面听见忍不住腹诽，结果弄出动静，被小兰发现。他情急之下带上了父亲的平板大眼镜，小兰过来，一见大喜，觉得这孩子好可爱，一把就搂在怀里。新一的脸蛋紧贴着小兰的柔胸，小手还不老实的摸起来，幸福得脸都红了，脑子里自然是想入非非。
博士急忙解释这孩子的亲人在意外事故中受了伤而拜托自己看顾的，小兰热情的抱着新一，松开后问他的名字，新一说，“我是新，啊，不不……江户川……柯南……”他恰好看到了书架上《江户川乱步》全集，而他爸爸又是柯南道尔的书迷，于是灵感一动，就以江户川柯南之名来掩饰身份。千钧苦笑原来柯南这个名字是这么诞生的啊。
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